ドメインプロパティ機能がリリースされたとのことなので試してみました。

プロパティを新規追加しようとすると下図の通り新しくDomainが増えている。URL prefixは以前同様のプロパティ。
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Domainに自分が保有しているドメインを登録し、CONTINUEボタンをクリックすると、Ownership auto verifiedと表示される。
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  • Domain propertyが登録された Image

こうすると、http://meganii.com でも https://meganii.com/ でもhttps://www.meganii.com/ でもまとめて見ることができる。逆に、サブドメインごとに結果を確認したい場合はあまりおすすめできないかも。